MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 5

Total Repeats: 335

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008507	TTG	2	6	31	36	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008507	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008507	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008507	ATTT	2	8	101	108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008507	T	6	6	106	111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008507	AT	3	6	124	129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008507	T	7	7	129	135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008507	ATT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008507	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008507	GTA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008507	GAT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008507	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008507	ATTA	2	8	333	340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008507	AGA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008507	TCT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008507	T	6	6	513	518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008507	TCG	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008507	TTGA	2	8	654	661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008507	AAT	2	6	667	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008507	TGA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008507	GAG	2	6	719	724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008507	GTA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008507	ATA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008507	AAAAC	2	10	880	889	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008507	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326646
26	NC_008507	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
27	NC_008507	TGTT	2	8	1265	1272	0 %	75 %	25 %	0 %	116326646
28	NC_008507	TCA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326646
29	NC_008507	CAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326646
30	NC_008507	ATTTT	2	10	1453	1462	20 %	80 %	0 %	0 %	116326646
31	NC_008507	ATG	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326646
32	NC_008507	TAAG	2	8	1543	1550	50 %	25 %	25 %	0 %	116326646
33	NC_008507	TAGTT	2	10	1609	1618	20 %	60 %	20 %	0 %	116326646
34	NC_008507	TGT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326646
35	NC_008507	CAA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326646
36	NC_008507	GAA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
37	NC_008507	TATT	2	8	1754	1761	25 %	75 %	0 %	0 %	116326646
38	NC_008507	TAAG	2	8	1787	1794	50 %	25 %	25 %	0 %	116326646
39	NC_008507	AAT	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326646
40	NC_008507	GAA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
41	NC_008507	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326646
42	NC_008507	CCT	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326647
43	NC_008507	GAT	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326647
44	NC_008507	ATA	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326647
45	NC_008507	GATA	2	8	2100	2107	50 %	25 %	25 %	0 %	116326647
46	NC_008507	G	6	6	2147	2152	0 %	0 %	100 %	0 %	116326647
47	NC_008507	AACC	2	8	2169	2176	50 %	0 %	0 %	50 %	116326647
48	NC_008507	TCA	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326647
49	NC_008507	TGAG	2	8	2249	2256	25 %	25 %	50 %	0 %	116326647
50	NC_008507	TGT	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326647
51	NC_008507	TAT	2	6	2317	2322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326647
52	NC_008507	TG	3	6	2366	2371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008507	TCC	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008507	A	7	7	2427	2433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008507	TTA	2	6	2461	2466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326648
56	NC_008507	TGA	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326648
57	NC_008507	TTA	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326648
58	NC_008507	TTC	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326648
59	NC_008507	AAG	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326648
60	NC_008507	TCA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
61	NC_008507	T	6	6	2689	2694	0 %	100 %	0 %	0 %	116326648
62	NC_008507	CAT	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
63	NC_008507	T	8	8	2763	2770	0 %	100 %	0 %	0 %	116326648
64	NC_008507	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326648
65	NC_008507	ATC	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
66	NC_008507	TCT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326648
67	NC_008507	TGTAAG	2	12	2913	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326648
68	NC_008507	CAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008507	ATA	2	6	3161	3166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008507	AAT	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008507	CAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008507	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008507	AGA	2	6	3311	3316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
74	NC_008507	ATT	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
75	NC_008507	AT	3	6	3365	3370	50 %	50 %	0 %	0 %	116326649
76	NC_008507	TTA	2	6	3400	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
77	NC_008507	TAGA	2	8	3499	3506	50 %	25 %	25 %	0 %	116326649
78	NC_008507	TAA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
79	NC_008507	A	8	8	3548	3555	100 %	0 %	0 %	0 %	116326649
80	NC_008507	CCCAA	2	10	3560	3569	40 %	0 %	0 %	60 %	116326649
81	NC_008507	GATTT	2	10	3609	3618	20 %	60 %	20 %	0 %	116326649
82	NC_008507	TAA	2	6	3632	3637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
83	NC_008507	AAT	2	6	3648	3653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
84	NC_008507	A	6	6	3662	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	116326649
85	NC_008507	GAA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
86	NC_008507	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	116326649
87	NC_008507	GAA	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
88	NC_008507	ACA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326649
89	NC_008507	TAA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
90	NC_008507	GTT	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326649
91	NC_008507	ATA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
92	NC_008507	T	6	6	3862	3867	0 %	100 %	0 %	0 %	116326649
93	NC_008507	CTA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326649
94	NC_008507	ATT	2	6	3912	3917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
95	NC_008507	AT	3	6	3948	3953	50 %	50 %	0 %	0 %	116326649
96	NC_008507	ATG	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326649
97	NC_008507	CTA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326649
98	NC_008507	T	6	6	4008	4013	0 %	100 %	0 %	0 %	116326649
99	NC_008507	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
100	NC_008507	A	6	6	4101	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008507	AT	3	6	4110	4115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008507	ATT	2	6	4152	4157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008507	TTA	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008507	A	9	9	4195	4203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008507	TTA	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008507	TAA	3	9	4271	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008507	TAGA	2	8	4300	4307	50 %	25 %	25 %	0 %	116326650
108	NC_008507	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	116326650
109	NC_008507	TA	3	6	4364	4369	50 %	50 %	0 %	0 %	116326650
110	NC_008507	ATC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326650
111	NC_008507	ATT	2	6	4381	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
112	NC_008507	T	6	6	4389	4394	0 %	100 %	0 %	0 %	116326650
113	NC_008507	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326650
114	NC_008507	ACC	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326650
115	NC_008507	TA	3	6	4500	4505	50 %	50 %	0 %	0 %	116326650
116	NC_008507	CAG	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326650
117	NC_008507	TTC	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326650
118	NC_008507	TCTT	2	8	4569	4576	0 %	75 %	0 %	25 %	116326650
119	NC_008507	GAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326650
120	NC_008507	AAT	2	6	4741	4746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326650
121	NC_008507	ATTTT	2	10	4769	4778	20 %	80 %	0 %	0 %	116326650
122	NC_008507	T	9	9	4791	4799	0 %	100 %	0 %	0 %	116326650
123	NC_008507	TTA	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
124	NC_008507	GAAT	2	8	4915	4922	50 %	25 %	25 %	0 %	116326650
125	NC_008507	TCC	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326650
126	NC_008507	ATT	2	6	5026	5031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
127	NC_008507	TTG	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326650
128	NC_008507	T	6	6	5099	5104	0 %	100 %	0 %	0 %	116326650
129	NC_008507	GTTCA	2	10	5112	5121	20 %	40 %	20 %	20 %	116326650
130	NC_008507	A	6	6	5136	5141	100 %	0 %	0 %	0 %	116326650
131	NC_008507	GATA	2	8	5164	5171	50 %	25 %	25 %	0 %	116326650
132	NC_008507	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
133	NC_008507	T	8	8	5192	5199	0 %	100 %	0 %	0 %	116326650
134	NC_008507	CTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008507	TGG	2	6	5246	5251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326651
136	NC_008507	TCA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
137	NC_008507	TACT	2	8	5281	5288	25 %	50 %	0 %	25 %	116326651
138	NC_008507	TAA	2	6	5290	5295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
139	NC_008507	TAG	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
140	NC_008507	ATC	2	6	5327	5332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
141	NC_008507	ATC	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
142	NC_008507	T	6	6	5366	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	116326651
143	NC_008507	AAT	2	6	5396	5401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
144	NC_008507	AAC	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326651
145	NC_008507	CT	3	6	5445	5450	0 %	50 %	0 %	50 %	116326651
146	NC_008507	AAT	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
147	NC_008507	T	6	6	5504	5509	0 %	100 %	0 %	0 %	116326651
148	NC_008507	TCT	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
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157	NC_008507	CTCTAT	2	12	5971	5982	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116326651
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163	NC_008507	ATTT	2	8	6137	6144	25 %	75 %	0 %	0 %	116326651
164	NC_008507	TAG	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
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166	NC_008507	TTAC	2	8	6234	6241	25 %	50 %	0 %	25 %	116326651
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272	NC_008507	T	6	6	11156	11161	0 %	100 %	0 %	0 %	116326653
273	NC_008507	TGG	2	6	11193	11198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326653
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325	NC_008507	TAG	2	6	13653	13658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
326	NC_008507	AT	3	6	13732	13737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.